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一、实验原理
免疫共沉淀是利用抗原和抗体的特异性结合以及细菌的protein g或a能特异性地结合到免疫球蛋白的fc片段的方法。其基本原理是在细胞裂解液中加入感兴趣蛋白的抗体,孵育后再加入与抗体特异结合的结合于磁珠的protein g或a,若细胞中存在与兴趣蛋白相结合的目的蛋白,就可以形成蛋白复合物:“目的蛋白—兴趣蛋白—抗兴趣蛋白抗体—protein g或a”;最后通过免疫印迹实验来检测目的蛋白。
当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留了下来。如果用蛋白质x的抗体免疫沉淀x,那么与x在体内结合的蛋白质y也能沉淀下来。co-ip确定的存在相互作用关系,但这种相互作用并不能确定使用直接作用还是间接作用。
1) 免疫共沉淀的优点
1. 相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的,处于天然状态。
2. 蛋白的相互作用是在自然状态下进行的,可以避免人为的影响。
3. 可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。
2) 免疫共沉淀的缺点
1. 可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质相互作用;
2. 两种蛋白质的结合可能不是直接结合,而可能有第三者在中间起桥梁作用;
3. 必须在实验前预测目的蛋白是什么,以选择最后检测的抗体,所以,若预测不正确,实验就得不到结果,方法本身具有冒险性。
二、应用简介
co-ip、chip、rip、pulldown作为常见的分子互作验证方法。它们可以从检验的出发点来区分:co-ip、chip、rip是利用已知的蛋白检测体内相关蛋白、dna、rna,并通过蛋白抗体免疫沉淀分离目标蛋白、dna、rna。pulldown则是根据已知rna(rna pulldown)或者已知蛋白(gst pulldown)体外检验相关蛋白。
co-ip主要用于检测蛋白质与蛋白质之间相互作用,是ip实验的一种扩展, 基于ip反应的潜力,在样品溶液中捕获和纯化主要目标(抗原等)及通过天然相互作用靶标结合的其他的大分子。此外,还可以利用co-ip来确定在不同条件下的蛋白质相互作用。
三、 实验方法
四、样本送检要求
五、案例展示
六、常见问题
1、实验样品制备方法准备:很重要!根据研究目的,检测样品可能是组织样品,也可能是细胞样品,不同样品制备流程不太相同,目的蛋白表达量也有较大差别,必须选择合适的样品和样品制备方法。
2、根据研究目的选择适合的蛋白特异性抗体:非常重要!用于co-ip实验的抗体是针对目的蛋白的特异性抗体,最理想的是选择一种能识别兴趣蛋白质某个表位的抗体,且这个表位不会被任何其他蛋白质相互作用所掩盖,比普通wb抗体要求高出很多;同时,抗体特异性和灵敏性尽可能高,才有可能有干净的背景和较好的ip效果,所以必须选择最适合的抗体用于co-ip实验。
3、未检测到目得蛋白或蛋白很少:
4、目得蛋白高背景:
七、服务流程
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